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尽管并不是广为人知，但电子废物确实是含有非常多的有毒物质，如电路板上的铅和镉；显示器中阴极射线管中的氧化铅和镉；纯平型显示器中的汞；电脑电池中的镉；电容和转换器中的聚氯乙稀（PCBs）；电路板中的溴化阻燃物；还有当燃烧电线取铜会释放出高毒性物质二噁英和呋喃的PVC塑料。
由于电子废物的有害性，处理和回收它们涉及到严格的法律和环保要求，当电脑废物被填埋或焚烧掉时，会产生很严重的污染问题，填埋会使有毒物渗漏到地下水中，而焚化则会产生包括二噁英等的气体有毒物。然而，电脑的回收处理也会牵涉到健康和环境问题，特别是当回收工业以利润为第一位，而不采取措施保护环境和工人健康时。
铅——铅的有害影响早已为人们所公认，早在70年代就被有的国家禁用于汽油中。铅能损伤人的中枢和脑神经系统、血液系统、肾以及生殖系统，而且会对小孩的大脑发育有负面影响，铅能在环境中累积，从而对动植物、微生物都有强烈而且长久的影响。电脑中的主要含铅部位有：电脑显示器的玻璃荧屏（1.4~3.5千克/每台显示器），电路板或其他元件的焊接物。
镉——镉的化合物对人也是非常有害的，会在人体中积累，尤其是在肾中。镉含于以下元件中，SMD电阻器，红外线发生器，半导体等，镉也是塑料的固化剂，在旧的阴极射线管中也含有它。
汞——汞会造成很多器官的损伤，包括大脑、肾、卵巢，更严重的是，胎儿的发育会对母体传过来的汞相当敏感。我们知道，当无机汞洒落入水中时，就会转化为甲基汞沉在底部。甲基汞很容易在体内积累，以及通过食物链富集，尤其是鱼。据估计全世界每年耗用的汞22%是用在电子电气产品中，它用于温度计、传感器、阻滞器、转换器（比如在电路板以及测量装置中），医疗设备、电灯、手机以及电池中。汞，现在用于纯平显示器荧屏，逐渐取代了原来的阴极射线管显示器。
六价铬——六价铬仍被用于钢片的防锈以及坚化和美化处理。它很容易穿过细胞膜然后被吸收，而后对被污染了的细胞产生毒害影响。六价铬也会损伤DNA，是一种在环境中极毒的物质。
包含PVC的塑料——每台电脑平均有13.8镑的塑料。大量的用于电子产品的塑料（26%）是含有PVC的，PVC主要是用于包裹线路和电脑外壳，尽管现在很多电脑模具已经开始用无毒的ABS塑料了。PVC被广泛应用主要是由于它的防火特性，同很多其它的含氯化合物一样，PVC在一定温度下燃烧时也会产生二噁英。
溴化阻燃物（BFRs）——BFRs被用在电子产品的塑料外壳